외무성은 요미우리 기사 내용을 보도 당일인 15일 오후 부인했다. 한국 정부의 강력한 항의에 따른 조치였다. 고다마 가즈오(兒玉和夫) 외무성 보도관(대변인)은 기자회견 모두(冒頭)발언을 통해 "정상회담에서, 보도된 것과 같은 논의가 이뤄진 사실이 없다"고 말했다. 그러나 요미우리 신문은 이후 어떤 반응도 보이지 않고 있다. 요미우리의 한 기자는 국내 언론과의 전화통화에서 "요미우리 기사는 모두 사실에 근거해 작성되기 때문에 이 기사의 내용도 모두 사실"이라고 했다. 요미우리는 문제의 기사를 17일 자사(自社) 웹사이트에서 삭제했다. 한때 기사삭제가 오보를 인정한 것 아니냐는 해석이 나오기도 했으나, 요미우리 측은 이마저도 사실이 아니라고 했다. 요미우리 측은 웹사이트에서 며칠 지난 기사를 삭제하는 것은 항상 있는 일이며 이번 기사 삭제도 이런 차원의 일이라고 했다. 최근의 논란과는 아무런 관계가 없다는 것이었다. 한국 정부는 이에 따라 일본 정부의 누군가가 의도적으로 요미우리 기자에게 '근거 없는' 말을 전했을 가능성도 있는 것으로 본다.

NHK 보도는 정부의 부인 해명 자체가 교묘했다. 문부성은 16일 보도자료를 통해 조기 시행 독려 방침은 사실이 아니라고 하면서도, "새로운 해설서의 취지를 고려해 각 학교에서 독도에 관한 지도를 하는 것은 가능하다. 이는 각 학교의 주체적 판단에 맡겨져 있다"고 했다. 진짜 하고 싶은 얘기가 무엇인지를 헷갈리게 하는 내용이었다.

한국 정부는 상황이 이렇게 전개되자, 일련의 일들이 일본 정부의 정교한 '언론플레이'에서 비롯된 일일 가능성이 높다는 심증을 굳혀가고 있다. 근거 없이 벌어진 일들이 아니라는 것이다.

그런 가운데 일본 신문들은 해설서 공표 다음날인 15일 하루 주요 뉴스로 다뤘을 뿐, 16일부터는 거의 보도를 하지 않기 시작했다. 이 역시 전형적인 '치고 빠지기 수법'이라는 얘기도 나온다.

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